Има обаче и още едно усложнение, което се дължи на факта, че дадено качество може да се определи от 3 различни генотипа при доминантните гени - АА, Аа и аА. И в трите случая пчелата ще показва качеството А, но само в 33.3% от случаите това качество НАДЕЖДНО ЩЕ БЪДЕ ПРЕДАДЕНО НА ПОКОЛЕНИЕТО. Това е когато имаме комбинация АА. Надеждно предаване на поколението (на 100%) ще имаме и когато са два рецесивни гена (аа).

Следователно за нас не е достатъчно само ДА ЗНАЕМ, че дадена майка проявава някакво добро или лошо качество. Ние искаме да сме СИГУРНИ, че това качество ще се предаде (няма да се предаде) на 100% в поколенията. Именно поради тази причина ние трябва да направим малко допълнителни изследвания ПРИ ВЗЕМАНЕ НА РЕШЕНИЕ ЗА СМЪРТ, като за тези допълнителни изследвания в част от случаите може да бъде достатъчен и един бегъл преглед на семейството. Именно поради тази причина си струва да включим и това второ ниво в селекцията, която може да се прави от всеки един пчелар.

Тука настана времето и за две нови сложни думички:

ХОМОЗИГОТНОСТ - когато двата алела на един и същи ген са ЕДНАКВИ (АА или аа), говорим за хомозиготност по това качество.

ХЕТЕРОЗИГОТНОСТ- когато двата алела на един и същи ген са РАЗЛИЧНИ (Аа или аА)

Близко е до ума, че когато имаме ХОМОЗИГОТНОСТ по дадено качество, то тогава наследяването е на 100% и в яйцето, търтея и новата пчела ще се копира същия ген и ще наблюдаваме същото качество. Ако обаче имаме ХЕТЕРОЗИГОТНОСТ (два различни алела), в новите пчели ще наблюдаваме както основното качество, така и неговото противоположно качество (съотношенията зависят от конкретната комбинация на конкретната майка и конкретните търтеи).